본 발명은 IL6 유전자 내의 단일염기다형성 마커를 포함하는 백혈구 감소증 발병 위험 예측용 조성물 및 이를 이용한 백혈구 감소증 발병 위험 예측 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 IL6 유전자 내의 단일염기다형성 마커는 약물, 특히 치오퓨린 계열 약물에 의해 유도되는 백혈구 감소증의 발병 위험과 높은 상관관계를 가지고 있는바, 이를 이용하여 백혈병, 크론병, 궤양성 대장염, 또는 장기이식 등에서 치오퓨린 계열 약물 치료 중 발생하는 백혈구 감소증에 대해 감수성이 높은 환자를 조기에 효과적으로 예측 또는 진단할 수 있고, 이를 통해 환자에게 적합한 약물을 투여하여 최적의 치료 효과를 달성할 수 있는 환자 맞춤형 치료를 효율적으로 수행할 수 있다. 나아가 본 발명에 따른 단일염기다형성 마커를 약물 유도 백혈구 감소증의 치료를 위한 약물 개발 연구에 활용할 수 있다.